Le aziende del Gruppo Microdata applicano un Sistema di Gestione per la Qualità in conformità ai requisiti della norma UNI EN ISO 9001:2008. Il certificato è stato rilasciato da British Standard Institution e comprende tutti i servizi erogati dalle aziende del Gruppo Microdata: gestione dei documenti e dei dati, attività di back office e servizi di Application Service Provider.
Microdata è un D.C.C. KODAK (Document Conversion Center Kodak): centro servizi di archiviazione ottica e microfilm certificato da Kodak per il quale la multinazionale si fa garante della bontà del risultato dell'archiviazione sia in termini di durata sia in termini di qualità. Inoltre Kodak, solo per i D.C.C. Kodak, garantisce il recupero/restauro gratuito, presso i propri laboratori negli Stati Uniti, degli archivi su microfilm danneggiati da incendi e alluvioni.
Microdata ha ottenuto il Certificato di Prevenzione Incendi, rilasciato esclusivamente dal Comando dei Vigili del Fuoco, sia per i magazzini di stoccaggio che per le sedi operative; questo rappresenta una garanzia fondamentale per la sicurezza di dati, immagini e documenti cartacei.